CSI New York basa i suoi episodi su una serie di delitti compiuti nella grande mela, ad investigare sulla scena del crimine c’e’ la squadra composta dai detective Mac Taylor, che ha un passato da marine ed ora e’ a capo del laboratorio della polizia scentifica di New York, e Stella Bonasera detective che collabora con Taylor alla direzione e conduzione dei lavori all’interno del laboratorio della scentifica.

Tra i personaggi principali che caratterizzano le indagini sui casi di omicidio ci sono Danny Messer, investigatore che intraprende una relazione con la Detective Monroe, che viene integrata nella seconda stagione della serie dopo la perdita del detective Aiden Burn.

Sheldon Hawkes e’ il medico legale del laboratorio, Don Flack e’ l’anello di collegamento tra il laboratorio e le pattuglie in strada, Sid Hammerback detective aggiunto alla squadra nella seconda stagione ed infine Adam Ross, tecnico di laboratorio specializzato molto professionale e rispettato dai colleghi della squadra.